Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR35Q9HC97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR35Q9HC97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPR35Q9HC97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR35Q9HC97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR35Q9HC97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms