Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CENPJQ9HC77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CENPJQ9HC77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms