Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNDIG1Q9H7V2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1Q9H7V2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1Q9H7V2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms