Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCAS3Q9H6U6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCAS3Q9H6U6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms