Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABDQ9H4I3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABDQ9H4I3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms