Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB1Q9H4B7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB1Q9H4B7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB1Q9H4B7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB1Q9H4B7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB1Q9H4B7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB1Q9H4B7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB1Q9H4B7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms