Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
OPN3Q9H1Y3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN3Q9H1Y3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN3Q9H1Y3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms