Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK2Q9H0K1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIK2Q9H0K1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK2Q9H0K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms