Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NIF3L1Q9GZT8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIF3L1Q9GZT8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIF3L1Q9GZT8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms