Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE41Q9C0J9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms