Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNTNAP4Q9C0A0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CNTNAP4Q9C0A0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms