Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXQ1Q9C009 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXQ1Q9C009 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXQ1Q9C009 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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