Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM6SF2Q9BZW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF2Q9BZW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms