Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTPBP4Q9BZE4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTPBP4Q9BZE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms