Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM43Q9BTV4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM43Q9BTV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM43Q9BTV4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms