Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TINF2Q9BSI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TINF2Q9BSI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TINF2Q9BSI4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TINF2Q9BSI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms