Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BPIFA3Q9BQP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BPIFA3Q9BQP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms