Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPIN3Q9BQK8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms