Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP8Q99708 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms