Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS8Q99627 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPS8Q99627 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPS8Q99627 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.1 ms