Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A3Q99624 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A3Q99624 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms