Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POP1Q99575 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POP1Q99575 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POP1Q99575 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POP1Q99575 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POP1Q99575 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POP1Q99575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POP1Q99575 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POP1Q99575 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POP1Q99575 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POP1Q99575 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POP1Q99575 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POP1Q99575 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POP1Q99575 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POP1Q99575 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POP1Q99575 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POP1Q99575 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POP1Q99575 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POP1Q99575 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POP1Q99575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POP1Q99575 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POP1Q99575 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POP1Q99575 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POP1Q99575 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POP1Q99575 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POP1Q99575 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POP1Q99575 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POP1Q99575 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POP1Q99575 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POP1Q99575 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POP1Q99575 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POP1Q99575 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POP1Q99575 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POP1Q99575 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POP1Q99575 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POP1Q99575 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POP1Q99575 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POP1Q99575 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POP1Q99575 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POP1Q99575 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POP1Q99575 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POP1Q99575 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POP1Q99575 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POP1Q99575 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POP1Q99575 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POP1Q99575 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POP1Q99575 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POP1Q99575 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POP1Q99575 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POP1Q99575 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POP1Q99575 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POP1Q99575 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POP1Q99575 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POP1Q99575 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POP1Q99575 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POP1Q99575 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms