Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP19Q99542 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP19Q99542 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP19Q99542 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MMP19Q99542 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP19Q99542 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP19Q99542 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP19Q99542 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP19Q99542 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP19Q99542 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP19Q99542 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMP19Q99542 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP19Q99542 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms