Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORT1Q99523 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORT1Q99523 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms