Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CRBNQ96SW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CRBNQ96SW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRBNQ96SW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRBNQ96SW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRBNQ96SW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRBNQ96SW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms