Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOX2Q96NM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOX2Q96NM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOX2Q96NM4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOX2Q96NM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1651.8 ms