Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00479Q96M42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00479Q96M42 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms