Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDHR1Q96JP9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR1Q96JP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDHR1Q96JP9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms