Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3IP1Q96FE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3IP1Q96FE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms