Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL53Q96EL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL53Q96EL3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms