Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN23Q96B33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN23Q96B33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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