Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NXPE3Q969Y0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NXPE3Q969Y0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NXPE3Q969Y0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms