Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3Q969T4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2E3Q969T4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms