Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXJ1Q92949 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXJ1Q92949 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXJ1Q92949 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXJ1Q92949 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXJ1Q92949 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.2 ms