Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD2Q92925 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD2Q92925 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD2Q92925 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD2Q92925 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD2Q92925 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD2Q92925 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCD2Q92925 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCD2Q92925 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCD2Q92925 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms