Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELL1Q92832 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELL1Q92832 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NELL1Q92832 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms