Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RORBQ92753 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORBQ92753 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORBQ92753 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORBQ92753 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORBQ92753 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORBQ92753 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORBQ92753 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORBQ92753 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORBQ92753 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORBQ92753 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORBQ92753 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORBQ92753 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORBQ92753 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORBQ92753 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORBQ92753 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORBQ92753 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORBQ92753 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RORBQ92753 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORBQ92753 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORBQ92753 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORBQ92753 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORBQ92753 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORBQ92753 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORBQ92753 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORBQ92753 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORBQ92753 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORBQ92753 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORBQ92753 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORBQ92753 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORBQ92753 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORBQ92753 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORBQ92753 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORBQ92753 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORBQ92753 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORBQ92753 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORBQ92753 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORBQ92753 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORBQ92753 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORBQ92753 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RORBQ92753 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RORBQ92753 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORBQ92753 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORBQ92753 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORBQ92753 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORBQ92753 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORBQ92753 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORBQ92753 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms