Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM1Q92611 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDEM1Q92611 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM1Q92611 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM1Q92611 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM1Q92611 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms