Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF47

ZFP90, Zinc finger protein 90 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP90Q8TF47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP90Q8TF47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP90Q8TF47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms