Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD1Q8TEB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDD1Q8TEB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDD1Q8TEB9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD1Q8TEB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms