Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACER1Q8TDN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACER1Q8TDN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACER1Q8TDN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms