Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIN3Q8TB24 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIN3Q8TB24 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIN3Q8TB24 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms