Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL11Q8NHH1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL11Q8NHH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL11Q8NHH1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL11Q8NHH1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms