Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CADM4Q8NFZ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CADM4Q8NFZ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM4Q8NFZ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms