Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC148Q8NFR7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC148Q8NFR7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms