Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIEQ8NEW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMIEQ8NEW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIEQ8NEW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMIEQ8NEW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMIEQ8NEW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIEQ8NEW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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