Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL23Q8NBE8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL23Q8NBE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL23Q8NBE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms