Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf106Q8NAJ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf106Q8NAJ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf106Q8NAJ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms