Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD42Q8N9B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42Q8N9B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms