Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00337Q8N6G1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00337Q8N6G1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms